O processo administrativo disciplinar havia sido concluído pela Polícia Federal em julho, com decisão pela demissão, que dependia da assinatura do ministro para ser formalizada. Eduardo está nos Estados Unidos desde fevereiro de 2025 e, após perder o mandato de deputado federal, deveria ter retornado ao cargo que ocupava na PF. O processo disciplinar foi aberto em fevereiro deste ano, e a Corregedoria da corporação determinou durante a apuração a entrega da carteira funcional e da arma de fogo.
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A demissão ocorre poucos dias após a Primeira Turma do Supremo Tribunal Federal manter, por unanimidade, a condenação de Eduardo a quatro anos e dois meses de prisão pelo crime de coação no curso do processo. Segundo a decisão do STF, ele articulou medidas junto aos Estados Unidos para pressionar autoridades brasileiras no contexto do processo envolvendo seu pai, Jair Bolsonaro.